Ponente
Descripción
Introducción: Las enfermedades inflamatorias mediadas por mecanismos inmunes o IMIDs (Immune Mediated Inflammatory Diseases), son enfermedades complejas en las que existe una fuerte interacción entre el genoma y el medio ambiente. Los polimorfismos del receptor de la vitamina D (VDR) y la Proteína de unión a la vitamina D (VDBP) se relacionan con la presencia de IMIDs.
Materiales y métodos: Estudio de asociación de polimorfismos de los genes VDR y VDBP con la susceptibilidad a padecer IMID en población paraguaya. Se incluyeron un total de 399 pacientes con IMIDs (i.e. Lupus Eritematoso Sistémico (LES), Esclerodermia (SS), Artritis Reumatoide (AR), y Psoriasis cutánea (PS) y 100 controles hipernormales de la misma población. Se genotiparon 4 SNPs, rs731236, rs7975232, rs2228570, rs4588. Posteriormente se validaron los resultados, comparándolos con pacientes españoles del IMID-Biobanc de Barcelona.
Resultados: Se incluyeron 399 individuos, 100 controles y 299 pacientes (99 AR, 100 LES, 50 ES, y 50 PSO). El 76% fueron del sexo femenino y el 24% del masculino, con un valor de la media de la edad de 43,7±14. Encontramos asociación para 2 SNPs de VDR: rs731236 (en LES y PS), y rs7975232 (en SS y PS). En el análisis de validación en población española se incluyeron 4815 individuos (907 LES, 1263 PS, 1191 AR) y 1454 individuos hipernormales. Encontramos asociación significativa (p<0.05, test alélico) para rs731236 con LES en ambas poblaciones. En el análisis caso-control para rs731236 y LES: G es un alelo protector y A es un alelo de riesgo.
Conclusión: el alelo A de los SNPs rs731236 y rs7975232 es un alelo de riesgo para desarrollar una IMIDs, tanto en población paraguaya como en española.
Conclusión
Se han identificado dos asociaciones significativas entre el alelo G del SNPs rs731236 y el alelo C del rs7975232 del gen VDR y la ausencia de una IMIDs. El alelo A del rs731236 es un alelo de riesgo para desarrollar LES y Psoriasis. La asociación del rs731236 del VDR fue validada en una cohorte independiente.
Metodología
Estudio de asociación de polimorfismos de los genes VDR y VDBP con la susceptibilidad a padecer IMID en población paraguaya. En este estudio se incluyeron un total de 299 pacientes con IMIDs (i.e. Lupus Eritematoso Sistémico (LES), Esclerodermia (ES), Artritis Reumatoide (AR), y Psoriasis cutánea (PSO) y 100 controles hipernormales (CO) de la misma población. Para la extracción de ADN se utilizó el kit PureLink® Genomic DNA, de acuerdo con el protocolo establecido en el BIOBANCO IMID-PY. El genotipado se realizó mediante la tecnología basada en la PCR a tiempo real Taqman (Life Technologies, EEUU). El análisis estadístico se realizó con el software de lenguaje estadístico Rv3.0.1 (www.R-project.org). Para realizar el estudio individual de cada SNP con el riesgo de desarrollar la enfermedad se realizó el test de asociación alélica mediante el test χ2 y un estudio de asociación genotipico. Se utilizó un modelo de regresión logística para identificar posibles confusores (i.e. edad y sexo) de las asociaciones encontradas. Para la validación de los resultaron se analizaron estos SNPs en una cohorte independiente española gracias al Grupo de Recerca de Reumatología de Barcelona (GRR-VHIR).La cohorte española fue genotipada previamente mediante la plataforma de genotipado de genoma completo Quad610 de Illumina.
Introducción
En la última década, los polimorfismos del gen VDR (i.e. VDR, VDBP) han sido más enfáticamente estudiados en las IMIDs (Immune Mediated Inflammatory Diseases) en diferentes poblaciones, pero los resultados reportados no han sido aún concluyentes.
Resultados
Se incluyeron 399 individuos, 100 controles y 299 pacientes (99 AR, 100 LES, 50 ES, y 50 PSO). El 76% fueron del sexo femenino, con un valor de la media de la edad de 43,7±14. Se genotiparon 4 SNPs, rs731236, rs7975232, rs2228570, rs4588. En la tabla 1 observamos el anlaisis de asocación (alélico y genotipico) de las 4 SNPs diferenciadas por enfermedad. Se constató una asociación significativa con el VDR, rs731236 (p alélico 0,03, OR: 0,64) para LES, rs731236 ( p alélico 0,049 y p genotípico 0.042 OR: 0,6) y rs797523 (p genotípico 0.016, OR:1,21) para psoriasis, y rs797523 (p alélico 0.012 y genotípico 0.0064) para ES . No se constató asociación entre los demás SNPs estudiados y las demás patologías incluidas. Se llevó a cabo el análisis de validación en una población independiente de origen español, donde encontramos asociación significativa (P<0.05) para rs731236 con LES. En población española, el alelo G tiene una frecuencia del 40.5% en controles (n=1134) mientras que en pacientes LES (n=833) tiene una frecuencia del 37.1%. El OR= 0.86 sigue por tanto, el mismo sentido que en la asociación original: G es un alelo protector, mientras que A es un alelo de riesgo
Objetivo
Identificar asociaciones entre SNPs de los genes VDR y VDBP con la susceptibilidad de padecer una IMIDs.
| Area | Ciencias de la Salud y Biomedicina |
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